Zoroastrianism var Irans nationella tro i över ett årtusende före den arabiska erövringen, vilket på djupet formade iransk filosofi, kultur och konst även efter att befolkningen konverterat till islam. Idag är cirka 98 % av iranierna muslimer, varav cirka 89 % identifierar sig som shia och cirka 9 % som sunnimuslimer. Denna fördelning står i skarp kontrast till resten av den muslimska världen, där sunnimuslimer vanligtvis utgör majoriteten.
Baha’i-tron har små samhällen utspridda över Iran, där de flesta anhängare är av persisk härkomst, även om det också finns anhängare bland azerbajdzjanska och kurdiska befolkningar.
Irans kristna befolkning omfattar cirka 250 000 armenier, cirka 32 000 assyrier och ett litet antal romersk-katolska, anglikanska och protestantiska iranier. Dessa kristna är främst ättlingar till ursprungsbefolkningen som konverterats av missionärer under 1800- och 1900-talen.
Judendomen är en officiellt erkänd tro i Iran, men liksom andra religiösa minoriteter har judisk befolkning mött förtryck och förföljelse under Ayatollah Khomeini och hans efterträdare.